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云南水质自动监测站是以水质在线分析仪器、取水系统、预处理系统、数据采集控制系统及集成辅助系统组成的水质在线监测系统，需要根据现场情况的变化进行调整。
水质在线分析仪器
联机水质分析仪按测量方法一般可分为电极法和光度法两种，应根据使用区域环境进行选取。
现在常用的水质分析仪器制造厂商有：美国HACH、法国SERES、德国WTW、德国KUNTZE、日本岛津、日本Horiba、奥地利SCAN等。
取水系统
系统设计主要是针对具有代表性、可靠性和连续性的水样品进行设计，其主要组成部分包括：取水头、取水泵、水样输送管道、速度调节流量几个部分。
根据取水方式的划分，直取式和浮筒式两种，直取式主要针对水位变化不大的区域环境，如污水厂、污染源、自来水涵管取水等，而浮筒式主要针对水位变化较大的区域环境使用，如地表水等。
预处理系统
水样品预处理的设计主要是消除干扰仪器分析和影响仪器使用的因素，同时又不失水样的代表性。
预处理方法一般包括自然沉降、物理过滤和渗透等，预处理的程度通常取决于水样的纯度。
一些分析仪在设计时已经考虑过进样的预处理，在系统集成时需要考虑与其配合。
数据采集控制系统
数据采集控制系统主要由可编程控制器、现场工业控制器、中心站计算机、变送器、执行器等组成。其功能主要包括:
1）控制整个在线监控系统的自动运行，主要在PLC写入程序后完成；
2）仪器分析数据的采集、存储和传输，这部分主要由工控机与数据采集传输模块协作完成。
集成辅助系统
辅助系统的设计主要是为了保证云南水质在线监控系统的连续稳定运行，需要根据现场情况的变化进行调整。
总体来说有以下几个方面需要注意:
1、管道清洗
管道中残留的污垢和产生的藻类污染水样，需要定期定量清洗管道，清洗方式和内容多样，目标是保证水样的真实性和代表性。
2、电力保障
电力的稳定与仪表分析的准确性和连续性直接相关，因此，一要尽量选择一个稳定的交流电网供接入；
其次，在交流电进入自动监测系统之前，需要对交流电进入自动监测系统之前重新进行整流，以应对突发性电流不稳态的情况；
最后，如有必要，可配置一个后备电源，以在停电时在线监测系统的正常工作。
3、雷击
防雷主要分为站房防雷、电源防雷和通讯防雷，遇到雷击时电流先击穿防雷器，以达到对仪器及系统设备的保护。在雷雨频繁的地区，这一点尤为重要，一旦发生雷雨，工作人员应尽快检查防雷器状况，如损坏要及时更换。
4、调节温湿度
适宜的温湿度对仪表稳定运行也很重要，这部分功能主要通过空调和除湿设备来实现。